充足的養分可以使秧苗健壯，抗病能力增強，有效提高水稻產量。正常情況下，基質土中按20%比例加入普通有機肥更好，每100平方米育苗基質土添加50斤有機肥。水稻育苗基質土配制時的要多次均勻混拌，結果至水份，ph值一致時可視為已經混拌均勻并可以使用。水稻育苗基質土配制一定要調酸，因為偏酸性條件下立枯病菌很難繁殖。正常情況下，水稻育苗基質土調酸至ph4.5較為適宜。